​Le Conseil stratégique peut, au besoin, créer des Comités de concertation. Lorsque mis en place, ces comités sont des espaces privilégiés pour réaliser la concertation à propos de la gestion intégrée du Saint-Laurent. Les participants de ces comités doivent être membres de la TCREF et la coordination s’assure que les participants soient représentatifs des différents intérêts en présence.
Les mandats des Comités de concertation sont définis dans le respect d’au moins un des critères suivants :
- L’objet de concertation est transversal et implique des membres de plusieurs secteurs d’activité ;
- L’objet de concertation est transversal et implique des membres de plusieurs territoires d’appartenance ;
- Comité de concertation ad hoc : comité de concertation dont le mandat est restreint dans le temps et dont les travaux mènent à la production d’un livrable qui clôt le processus de concertation engagé ;
- Comité de concertation permanent : comité dont le mandat est continu et pour lequel il importe d’assurer la pérennité du processus de concertation.
Des comités de concertation ont été mis en place afin de travailler sur les quatre chantiers de travail prioritaires suivants​ :​​
